Er zijn veel soorten truffels. Een van de belangrijkste is de witte truffel, of Tuber magnatum, die vooral in de regio Piemonte in Noord-Italië, maar ook in delen van Kroatië, Servië en Frankrijk voorkomt. De geur is onderscheidend en wordt vaak gebruikt in de high-end keuken. Een andere kostbare soort is de zwarte truffel, of Tuber melanosporum. Het wordt voornamelijk geproduceerd in de Perigord-regio van Frankrijk, maar is ook te vinden in Italië, Spanje en enkele andere landen. Er zijn ook zomerzwarttruffels (Tuber Aestivum Vittadini) met een delicate geur en winterzwarttruffels (Tuber Brumale Vittadini) die bekend staan om hun sterke, blijvende geur. Ook de bianchetto truffel (Tuber Borchii Vittadini) heeft een aanvankelijk zwakke geur, maar ruikt later sterk naar knoflook.