Der findes mange typer trøfler. En af de vigtigste er den hvide trøfl, eller Tuber magnatum, som hovedsagelig findes i Piemontområdet i Norditalien, samt i nogle områder i Kroatien, Serbien og Frankrig. Dets duft er karakteristisk, og det bruges ofte i højklassekokken. En anden dyrebare varians er den sorte trøfl, eller Tuber melanosporum. Den produceres hovedsagelig i Perigordområdet i Frankrig, men findes også i Italien, Spanien og andre lande. Derudover findes der sommer sorte trøfler (Tuber Aestivum Vittadini) med en blid duft og vinter sorte trøfler (Tuber Brumale Vittadini), som er kendt for deres stærke og varig duft. Desuden har den bianchetto-trøfl (Tuber Borchii Vittadini) en duft, der først er svag, men senere ligner stærk knoflægeduft.